Kontrowersje wokół IDEAS NCBR wybuchły, gdy w konkursie na stanowisko prezesa tego ośrodka dotychczasowy lider i jego założyciel, prof. UW Piotr Sankowski przegrał z mało znanym w środowisku osób zajmujących się sztuczną inteligencją prof. Grzegorzem Borowikiem z Naukowej i Akademickiej Sieci Komputerowej (NASK).